Każdy ze skanerów VirusScan Enterprise umożliwia dostrojenie listy skanowanych typów plików. Na przykład ze skanowania można wykluczyć pojedyncze pliki, foldery i dyski. Wykluczenia te mogą być konieczne, ponieważ skanery mogą skanować i blokować plik w czasie, gdy jest on używany przez bazę danych lub serwer. Może to spowodować awarię bazy danych lub serwera albo wygenerowanie błędów.